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Edição CRISPR livre de modelos previsível e precisa de variantes patogênicas

Edição CRISPR livre de modelos previsível e precisa de variantes patogênicas

Após a clivagem de Cas9, o reparo de DNA sem um padrão de doador é geralmente considerado estocástico, heterogêneo e impraticável, além da ruptura do gene. Neste estudo, é mostrado que a edição Cas9 isenta de modelos é previsível e capaz de uma reparação precisa de um genótipo previsto, permitindo a correção de mutações associadas a doenças em humanos. Foi contruido uma biblioteca de 2.000 RNAs Cas9 emparelhados com locais alvo de DNA e treinados em Delfos, um modelo de aprendizado de máquina que prevê genótipos e freqüências de deleções de 1 a 60 pares de bases e inserções de 1 par de bases com alta precisão ( r = 0,87) em cinco linhas celulares humanas e de murganho. inDelphi prevê que 5-11% dos RNAs Cas9 direcionados ao genoma humano são “precisos -50”, produzindo um único genótipo que compreende mais de ou igual a 50% de todos os principais produtos de edição.Experimentalmente  foi confirmado precisas-50 inserções e deleções em 195 alelos humanos relevantes para a doença, incluindo correção em fibroblastos derivados de pacientes primários de alelos patogênicos para genótipo de tipo selvagem para a síndrome de Hermansky-Pudlak e doença de Menkes. Este estudo estabelece uma abordagem para edição precisa e sem modelo de genoma.

 

Fonte: Nature

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